Історія ДЕРЖАВНОГО ПРОФЕСІЙНО-ТЕХНІЧНОГО НАВЧАЛЬНОГО ЗАКЛАДУ «КОНОТОПСЬКЕ ВИЩЕ ПРОФЕСІЙНЕ УЧИЛИЩЕ» бере початок в місті Конотоп, де Управлінням Московсько-Києво-Воронезької залізниці в 1920 році заснована Школа учнівства Конотопських залізничних майстерень та на його базі шляхом реорганізацій і перейменувань відкривались наступні заклади освіти залізничного спрямування: Залізничне училище фабрично-заводського навчання м. Конотоп (з 1932 року), Залізничне училище № 1 м. Конотоп (з 1940 року), Міське професійно-технічне училище № 4 м. Конотоп (з 1962 року).
  Складовою частиною історії ДЕРЖАВНОГО ПРОФЕСІЙНО-ТЕХНІЧНОГО НАВЧАЛЬНОГО ЗАКЛАДУ «КОНОТОПСЬКЕ ВИЩЕ ПРОФЕСІЙНЕ УЧИЛИЩЕ» є історія Державного професійно-технічного навчального закладу «Конотопський професійний ліцей», яка бере початок в місті Конотоп Сумської області, де відповідно до наказу Сумського обласного управління трудових резервів від 23.12.1943 № 38 з метою підготовки робітничих кадрів для будівельно-відновлювальних робіт з 1 лютого 1944 року відкрита Школа фабрично-заводського навчання № 6 м. Конотоп на базі якої шляхом реорганізацій і перейменувань відкривались наступні заклади освіти будівельного спрямування: Будівельна школа № 3 м. Конотоп (1953 рік), Будівельне училище № 3 м. Конотоп (1957 рік), Міське професійно-технічне училище № 8 м. Конотоп (1961 рік).
     Відповідно до наказу Державного комітету Української РСР з професійно-технічної освіти від 13.07.1984 № 156/3 «Про реорганізацію профтехучилищ системи профтехосвіти Української РСР» та згідно з наказом Сумського обласного управління професійно-технічної освіти від 14.08.1984 № 202 «Про реорганізацію профтехучилищ системи профтехосвіти області» Міське професійно-технічне училище № 4 м. Конотоп, Міське професійно-технічне училище № 8 м. Конотоп реорганізовані та перейменовані відповідно на Середнє професійно-технічне училище № 4 м. Конотоп Сумської області, Середнє професійно-технічне училище № 8 м. Конотоп Сумської області, які в
1992 році перейменовані відповідно на Професійно-технічне училище № 4 м. Конотоп Сумської області, Професійно-технічне училище № 8 м. Конотоп Сумської області.
    Згідно з наказом Міністерства освіти України від 17.08.1993 № 234 «Про реорганізацію ПТУ у вищі професійні училища» Професійно-технічне училище № 4 м. Конотоп Сумської області з 1 вересня 1993 року реорганізовано у Вище професійне училище № 4 м. Конотоп.
   Відповідно до наказу Міністерства освіти і науки України від 12.06.2003 № 368 «Про вдосконалення мережі професійно-технічних навчальних закладів Сумської області» Професійно-технічне училище № 8 м. Конотоп з 1 липня 2003 року реорганізовано у Конотопський професійний ліцей.
   Згідно з наказом Міністерства освіти і науки України від 26.02.2008 № 131 «Про перейменування професійно-технічних навчальних закладів Сумської області» Вище професійне училище № 4 м. Конотоп, Конотопський професійний ліцей перейменовані відповідно на ДЕРЖАВНИЙ ПРОФЕСІЙНО-ТЕХНІЧНИЙ НАВЧАЛЬНИЙ ЗАКЛАД «КОНОТОПСЬКЕ ВИЩЕ ПРОФЕСІЙНЕ УЧИЛИЩЕ», Державний професійно-технічний навчальний заклад «Конотопський професійний ліцей».
   Відповідно до наказу Міністерства освіти і науки України від 28.08.2019 № 1160 «Про реорганізацію закладів професійної (професійно-технічної) освіти міста Конотоп Сумської області»: 1) припинено Державний професійно-технічний навчальний заклад «Конотопський професійний ліцей» шляхом приєднання до ДЕРЖАВНОГО ПРОФЕСІЙНО-ТЕХНІЧНОГО НАВЧАЛЬНОГО ЗАКЛАДУ «КОНОТОПСЬКЕ ВИЩЕ ПРОФЕСІЙНЕ УЧИЛИЩЕ»; 2) встановлено, що ДЕРЖАВНИЙ ПРОФЕСІЙНО-ТЕХНІЧНИЙ НАВЧАЛЬНИЙ ЗАКЛАД «КОНОТОПСЬКЕ ВИЩЕ ПРОФЕСІЙНЕ УЧИЛИЩЕ» є правонаступником всього майна, прав та обов’язків Державного професійно-технічного навчального закладу «Конотопський професійний ліцей».
    ДЕРЖАВНИЙ ПРОФЕСІЙНО-ТЕХНІЧНИЙ НАВЧАЛЬНИЙ ЗАКЛАД «КОНОТОПСЬКЕ ВИЩЕ ПРОФЕСІЙНЕ УЧИЛИЩЕ», також є правонаступником Вищого професійного училища № 4 м. Конотоп.
Вище професійне училище утворене та зареєстроване в порядку, визначеному законодавством, що регулює діяльність відповідного неприбуткового закладу (організації).